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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
13/06/2022 |
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Data da última atualização: |
13/06/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SALIM, J. A.; SARAIVA, A. M.; ZERMOGLIO, P. F.; AGOSTINI, K.; WOLOWSKI, M.; DRUCKER, D. P.; SOARES, F. M.; BERGAMO, P. J.; VARASSIN, I. G.; FREITAS, L.; MAUES, M. M.; RECH, A. R.; VEIGA, A. K.; ACOSTA, A. L.; ARAUJO, A. C.; NOGUEIRA, A.; BLOCHTEIN, B.; FREITAS, B. M.; ALBERTINI, B. C.; MAIA-SILVA, C.; NUNES, C. E. P.; PIRES, C. S. S.; SANTOS, C. F. dos; QUEIROZ, E. P.; CARTOLANO, E. A.; OLIVEIRA, F. F. de; AMORIM, F. W.; FONTÚRBEL, F. E.; SILVA, G. V. da; CONSOLARO, H.; ALVES-DOS-SANTOS, I.; MACHADO, I. C.; SILVA, J. S.; ALEIXO, K. P.; CARVALHEIRO, L. G.; ROCCA, M. A.; PINHEIRO, M.; HRNCIR, M.; STREHER, N. S.; FERREIRA, P. A.; ALBUQUERQUE, P. M. C. de; MARUYAMA, P. K.; BORGES, R. C.; GIANNINI, T. C.; BRITO, V. L. G. |
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Afiliação: |
JOSÉ A. SALIM, USP; ANTONIO M. SARAIVA, USP; PAULA F. ZERMOGLIO, UNIVERSIDAD DE BUENOS AIRES; KAYNA AGOSTINI, UFSCAR; MARINA WOLOWSKI, UNIFAL; DEBORA PIGNATARI DRUCKER, CNPTIA; FILIPI M. SOARES, USP; PEDRO J. BERGAMO, JARDIM BOTÂNICO DO RIO DE JANEIRO; ISABELA G. VARASSIN, UFPR; LEANDRO FREITAS, JARDIM BOTÂNICO DO RIO DE JANEIRO; MARCIA MOTTA MAUES, CPATU; ANDRÉ R. RECH, UNIVERSIDADE FEDERAL DOS VALES DO JEQUITINHONHA E MUCURI, DIAMANTINA; ALLAN K. VEIGA, USP; ANDRE L. ACOSTA, INSTITUTO TECNOLÓGICO VALE, BELÉM; ANDRÉA C. ARAUJO, UFMS; ANSELMO NOGUEIRA, UFABC; BETINA BLOCHTEIN, PUCRS; BRENO M. FREITAS, UFC; BRUNO C. ALBERTINI, USP; CAMILA MAIA-SILVA, UNIVERSIDADE FEDERAL RURAL DO SEMI-ÁRIDO; CARLOS E. P. NUNES, UNIVERSITY OF STIRLING; CARMEN SILVIA SOARES PIRES, Cenargen; CHARLES F. DOS SANTOS, PUCRS; ELISA P. QUEIROZ, USP; ETIENNE A. CARTOLANO, USP; FAVÍZIA F. DE OLIVEIRA, UFBA; FELIPE W. AMORIM, UNESP; FRANCISCO E. FONTÚRBEL, PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DE VALPARAÍSO, CHILE; GLEYCON V. DA SILVA, INPA; HÉLDER CONSOLARO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE CATALÃO; ISABEL ALVES-DOS-SANTOS, USP; ISABEL C. MACHADO, UFPE; JULIANA S. SILVA, INSTITUTO FEDERAL DE EDUCAÇÃO CIÊNCIA E TECNOLOGIA DE MATO GROSSO; KÁTIA P. ALEIXO, ASSOCIAÇÃO BRASILEIRA DE ESTUDOS DAS ABELHAS; LUÍSA G. CARVALHEIRO, UFG, UNIVERSITY OF LISBOA; MÁRCIA A. ROCCA, UFS; MARDIORE PINHEIRO, UNIVERSIDADE FEDERAL DA FRONTEIRA SUL; MICHAEL HRNCIR, USP; NATHÁLIA S. STREHER, UNIVERSITY OF PITTSBURGH; PATRICIA A. FERREIRA, UFSCAR; PATRICIA M. C. DE ALBUQUERQUE, UFMA; PIETRO K. MARUYAMA, UFMG; RAFAEL C. BORGES, INSTITUTO TECNOLÓGICO VALE, BELÉM; TEREZA C. GIANNINI, INSTITUTO TECNOLÓGICO VALE, BELÉM; VINÍCIUS L. G. BRITO, UFU. |
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Título: |
Data standardization of plant-pollinator interactions. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
GigaScience, v. 11, p. 1-15, 2022. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1093/gigascience/giac043 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract. Background: Animal pollination is an important ecosystem function and service, ensuring both the integrity of natural systems and human well-being. Although many knowledge shortfalls remain, some high-quality data sets on biological interactions are now available. The development and adoption of standards for biodiversity data and metadata has promoted great advances in biological data sharing and aggregation, supporting large-scale studies and science-based public policies. However, these standards are currently not suitable to fully support interaction data sharing. Results: Here we present a vocabulary of terms and a data model for sharing plant-pollinator interactions data based on the Darwin Core standard. The vocabulary introduces 48 new terms targeting several aspects of plant-pollinator interactions and can be used to capture information from different approaches and scales. Additionally, we provide solutions for data serialization using RDF, XML, and DwC-Archives and recommendations of existing controlled vocabularies for some of the terms. Our contribution supports open access to standardized data on plant-pollinator interactions. Conclusions: The adoption of the vocabulary would facilitate data sharing to support studies ranging from the spatial and temporal distribution of interactions to the taxonomic, phenological, functional, and phylogenetic aspects of plant-pollinator interactions. We expect to fill data and knowledge gaps, thus further enabling scientific research on the ecology and evolution of plant-pollinator communities, biodiversity conservation, ecosystem services, and the development of public policies. The proposed data model is flexible and can be adapted for sharing other types of interactions data by developing discipline-specific vocabularies of terms. MenosAbstract. Background: Animal pollination is an important ecosystem function and service, ensuring both the integrity of natural systems and human well-being. Although many knowledge shortfalls remain, some high-quality data sets on biological interactions are now available. The development and adoption of standards for biodiversity data and metadata has promoted great advances in biological data sharing and aggregation, supporting large-scale studies and science-based public policies. However, these standards are currently not suitable to fully support interaction data sharing. Results: Here we present a vocabulary of terms and a data model for sharing plant-pollinator interactions data based on the Darwin Core standard. The vocabulary introduces 48 new terms targeting several aspects of plant-pollinator interactions and can be used to capture information from different approaches and scales. Additionally, we provide solutions for data serialization using RDF, XML, and DwC-Archives and recommendations of existing controlled vocabularies for some of the terms. Our contribution supports open access to standardized data on plant-pollinator interactions. Conclusions: The adoption of the vocabulary would facilitate data sharing to support studies ranging from the spatial and temporal distribution of interactions to the taxonomic, phenological, functional, and phylogenetic aspects of plant-pollinator interactions. We expect to fill data and knowledge gaps, thus further enabling sc... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Biodiversity informatics; Biodiversity information; Darwin Core; Informação sobre biodiversidade; Informática para biodiversidade; Interação planta-polinizador; Padronização de dados; Polinizador; Pollinator; Termos de vocabulário; Vocabulary of terms. |
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Thesagro: |
Biodiversidade; Polinização. |
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Thesaurus Nal: |
Pollination. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1143956/1/AP-Data-standardization-2022.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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| 21. |  | RODRIGUES, A. F. G.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; OLIVEIRA, H. C. de; SAVOLDI, I. R.; SOUZA, M. R.; MORES, M. A. Z.; CARREÑO, L. O. D.; LEDUR, M. C. Genes and SNPs Involved with Scrotal and Umbilical Hernia in Pigs. Genes, v. 12, n. 166, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 22. | | TEIXEIRA, S. A.; IBELLI, A. M. G.; CANTAO, M. E.; OLIVEIRA, H. C. de; LEDUR, M. C.; PEIXOTO, J. de O.; MARQUES, D. B. D.; COSTA, K. A.; COUTINHO, L. L.; GUIMARÃES, S. E. F. Sex determination using RNA-sequencing analyses in early prenatal pig development. Genes, v. 10, n. 1010, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 23. | | LORENZETTI, W. R.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; MORES, M. A. Z.; SAVOLDI, I. R.; CARMO, K. B. do; OLIVEIRA, H. C. de; LEDUR, M. C. Identification of endogenous normalizing genes for expression studies in inguinal ring tissue for scrotal hernias in pigs. Plos One, v. 13, n.9, e0204348, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 24. | | CAMPOS, F. G.; IBELLI, A. M. G.; OLIVEIRA, H. C. de; CANTAO, M. E.; PEIXOTO, J. de O.; TEIXEIRA, S. A.; COSTA, K. A.; LEDUR, M. C.; GUIMARÃES, S. E. F. Manual para identificação de RNAs longos não codificantes (lncRNAs) por meio de ferramentas bioinformáticas na análise de transcriptomas. Concórdia: Embrapa Suínos e Aves, 2023. 41 p. (Embrapa Suínos e Aves. Documentos, 244).| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 25. | | DAL PIZZOL, M. S.; IBELLI, A. M. G.; CANTAO, M. E.; CAMPOS, F. G.; OLIVEIRA, H. C. de; PEIXOTO, J. de O.; FERNANDES, L. T.; TAVERNARI, F. de C.; MORES, M. A. Z.; BASTOS, A. P. A.; LEDUR, M. C. Differential expression of miRNAs associated with pectoral myopathies in young broilers: insights from a comparative transcriptome analysis. BMC Genomics, v. 25, n. 104, p. 1-14, 2024.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Suínos e Aves. |
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| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 27. | | ABREU, E. F. M.; TINOCO, M. L. P.; JESUS, C. C. de; OLIVEIRA, H. C. de; RAMALHO, C. S.; ANDRADE, E. C. de; VIANNA, G. R.; ARAGAO, F. J. L. Embriogênese somática do mamoeiro e estabelecimento de um protocolo de seleção com Glufosinato de Amônio (GA) visando à geração de plantas geneticamente modificadas. In: SIMPÓSIO DO PAPAYA BRASILEIRO, 5., 2011, Porto Seguro. Inovação e sustentabilidade: anais. Porto Seguro: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2011. 1 CD-ROM. PDF. T27.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 28. | | DAL PIZZOL, M. S.; IBELLI, A. M. G.; CANTAO, M. E.; PEIXOTO, J. de O.; FERNANDES, L. T.; MORES, M. A. Z.; CAMPOS, F. G.; OLIVEIRA, H. C. de; LEDUR, M. C. MicroRNAS da via de sinalização da insulina envolvidos na manifestação de white striping em frangos de corte aos 28 dias de idade. In: WORKSHOP DE CIÊNCIA, TECNOLOGIA E INOVAÇÃO, 7., 2023, Francisco Beltrão. Anais... Francisco Beltrão: UTFPR, 2023. p. 429-438.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 31. | | TEIXEIRA, S. A.; MARQUES, D. B. D.; COSTA, T. C.; OLIVEIRA, H. C.; COSTA, K. A.; CARRARA, E. R.; SILVA, W. da; GUIMARÃES, J. D.; NEVES, M. N.; IBELLI, A. M. G.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C.; PEIXOTO, J. de O.; GUIMARÃES, S. E. F. Transcription landscape of the early developmental biology in pigs. Animals, v. 11, n. 1443, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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